1F：预防医学门诊室

2F：领证室、预防医学门诊室

3F：血吸虫病与地方病防制科、艾滋病结核病防制科、环境卫生与病媒防制科、职业卫生与放射卫生监督科、慢病防制与职业健康科

4F：健康教育与慢病防制科、卫生应急管理科（传染病防制科）、财务科、免疫规划与学校卫生科、办证与内部稽查科、微生物检验科

5F：主任室、副主任室、工会主席室、办公室、会议室、理化检验科

6F：微生物检验科